(1)荧光通道

   荧光通道表示一种生物芯片检测仪能够检测几种荧光，能衡量生物芯片检测仪器的基本检测能力， GRM2165C1H102JA01D能够检测的荧光通道越多，表明检测能力越强。激光共聚焦扫描仪一般配置两种激光器，只能检测两种荧光染料，如臬需要检测其他的荧光染料，则需要更换激光器，代价高昂，并且激光器受激光离散性及中心频率的限制，只能有几种荧光染料能用。例如，用CY3和CY5荧光染料标记，激光器价格就不算太高，而其他的则非常昂贵。CCD生物芯片 检测仪的激发光源为氙灯，发光波长在整个可见光范围内，需要检测其他的荧光染料，只需更换发射和激发滤光片，不需要设备升级。

   (2)检测效率

   检测效率是衡量一种生物芯片检测仪的主要指标，它是指检测一片生物芯片所需要的时间，对于医院尤其显得重要。激光共聚焦扫描仪采用PMT作为探测器，需要高速二维扫描台逐点成像，结构复杂，检测时间长，一般为5～10 min;而CCD生物芯片检测仪是一次成像，结构简单，检测时间短，一般为0.1～1 min，因此为众多医院所青睐。由于检测时间短，可以多采集几幅图片做图像滤波处理，有剩于减少噪声。