生物芯片在与荧光标记的目标DNA或RNA杂交后，或与荧光标记的目标抗原或抗体结合后，GBU8K-E3/51必须用扫读装置将芯片测定结果转换成可供分析处理的图像数据，这便是芯片的扫描测定步骤，扫读装置便是芯片扫描仪。与芯片的制作、芯片的杂交一样，芯片扫读也直接影响芯片分析结果的质量。因此，生物芯片检测仪是生物芯片能否得到广泛应用的关键，也是生物芯片技术向前发展的主研究课题之一。随着芯片集成度的提高，使用的反应样品越来 越少，产生的信号越来越微弱，对检测系统的要求也就越来越高，必须满足很高的检测灵敏度、高信噪比及大动态范围。另外，为提高检测效率，适应快速扫描，对检测系统的响应速 度也提出了更高的要求。

   目前，大部分生物芯片采用荧光染料标记，它利用强光照明生物芯片激发荧光，并用探测器探测荧光强度，以获取生物芯片信息，然后经过分析软件处埋成有用的生物信息。目前生物芯片检测仪主要有两种方法对荧光信号进行获取和定量分析。一种是基于CCD（Charge-Coupled Devices）的方法检测；另一种则是基于PMT（PhotoMultiplier Tube，光电倍增管）的激光共聚焦检测系统。利用CCD摄像原理的图像检测系统相对于利用激光共聚焦原理的扫描检测仪结构简单，检测速度快，能够检测多种光，对于点阵中斑点直径相对较大的生物芯片采用CCD生物芯片检测仪有明显的优势；但在探测灵敏度和分辨率方面，激光共聚焦扫描检测仪仍具有较大的优势。